高雄關表示，自由貿易港區事業每年應辦理存貨盤點，並於盤點後1個月內，將盤存清冊及結算報告表送海關備查；必要時，得於期限內申請展延1個月。自由貿易港區事業未依規定定期盤點或送海關備查，由海關處新臺幣3萬元以上30萬元以下罰鍰，並命其限期改正；屆期未改正者，得由海關停止其6個月以內之進儲貨物或由自由貿易港區管理機關廢止其營運許可。
       高雄關說明，取得營運許可之自由貿易港區事業，應於海關公告監管之翌日起10至14個月間擇期辦理第1次年度盤點；其後除有特殊情形，事先報經海關核准，得酌予提前或延後外，每一年度盤點日期，距上年度盤點日期最少不得少於10個月，最多不得超過14個月。
       高雄關再次提醒，自由貿易港區事業應於盤點日前2週通知海關，並經海關確認盤點日期。近來發現部分業者未在規定期限內辦理年度盤點，遭處罰鍰等情事，籲請業者務必遵循辦理，切勿心存僥倖以免受罰。

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