財政部北區國稅局表示，依據所得稅法第39條第1項但書規定，公司組織的營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經稽徵機關核定的前10年內各期虧損，自本年純益額中扣除後，再行核課。

該局進一步說明，營利事業倘涉及短漏報所得額情節，原則上不得適用盈虧互抵，惟如符合財政部83年7月13日台財稅第831601175號函規定短漏報所得稅稅額不超過新臺幣（下同）10萬元或短漏報課稅所得額占全年所得額的比例不超過5%，且非以詐術或其他不正當方法逃漏稅捐者，得視為短漏報情節輕微，仍准適用所得稅法第39條虧損扣除的規定。

該局舉例說明，甲公司113年度營利事業所得稅經會計師查核簽證申報全年所得額虧損430萬元。嗣經查核發現，該公司短漏報所得額730萬元，核定全年所得額300萬元，短漏所得稅稅額60萬元（300萬元×稅率20%），且尚有前10年核定虧損未扣除餘額2,600萬元，由於該短漏報所得額占全年所得額的比例已超過5%（短漏報所得額730萬元/全年所得額300萬元=243%），且短漏報所得稅稅額亦已超過10萬元，已不符前揭函釋所稱短漏報情節輕微的要件，不得適用盈虧互抵規定，並補稅處罰。

該局提醒，營利事業適用盈虧互抵規定時，應注意所得稅法相關規定，以維護適用盈虧互抵的權益。如仍有相關疑義，可撥打免費服務電話0800-000321洽詢，該局將竭誠提供詳細諮詢服務。

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