租稅協定科

1. 租稅協定之洽簽、訂定、修正、終止及條文解釋、相關法規訂定、修正及廢止之研擬。
2. 國際租稅組織及其相關會議之處理。
3. 租稅協定發展趨勢之研究、租稅協定內涵與效益之溝通說明。
4. 其他有關租稅協定事項。
5. 臺灣地區與大陸地區有關前述業務之辦理。

國際關務科

1. 關務互助協定之洽簽、訂定、修正、終止及條文解釋。
2. 貨物暫准通關證協定之洽簽、訂定、修正、終止及條文解釋。
3. 國際關務合作之規劃與推動及關務會議之規劃、參與與舉辦。
4. 國際關務組織及其相關會議之處理。
5. 臺灣地區與大陸地區有關前述業務之辦理。
6. 其他綜合性事務，及其他有關關務協定事項。

租稅合作科

1. 租稅協定資訊交換及相互協議程序相關法令之訂定、修正、廢止及解釋。
2. 審查租稅協定資訊交換個案請求與自發提供案件，執行自動交換。
3. 辦理租稅協定相互協議程序案件。
4. 其他有關租稅合作事項。
5. 臺灣地區與大陸地區有關前述業務之辦理。

財金合作科

1. 規劃推動本部參與亞太經濟合作財長程序相關會議與活動。
2. 規劃推動本部參與亞洲開發銀行、中美洲銀行、歐洲復興開發銀行及美洲開發銀行相關會議與活動。
3. 辦理蒞部外賓交流會議及部、次長出訪洽談財政合作事宜。
4. 財政合作協定及相關行動計畫之洽簽、訂定、修正、終止與執行。
5. 其他有關財金合作事項。
6. 臺灣地區與大陸地區有關前述業務之辦理。