財政部主管全國財政，依「財政部組織法」、「財政部處務規程」及「財政部編制表」等規定，除設置部長1人、次長3人（政務次長2人及常務次長1人）、主任秘書1人以外，設下列單位及機關（構）：
一、部內單位：綜合規劃司、國際財政司、推動促參司、秘書處、人事處、政風處、會計處、統計處及法制處等9個單位，暨參事、技監等。
二、所屬機關（構）：國庫署、賦稅署、臺北國稅局、高雄國稅局、北區國稅局、中區國稅局、南區國稅局、國有財產署、關務署、財政資訊中心等10個三級機關，及直屬本部之四級機構財政人員訓練所。
三、所屬事業機構：臺灣金融控股股份有限公司及其下臺灣銀行股份有限公司（下設臺銀綜合保險經紀人股份有限公司）、臺銀人壽保險股份有限公司、臺銀綜合證券股份有限公司，另設臺灣土地銀行股份有限公司、中國輸出入銀行、臺灣菸酒股份有限公司、財政部印刷廠等9個事業機構。
※註：自93年7月1日起，原財政部保險司、財政部金融局、財政部證券暨期貨管理委員會 改隸行政院金融監督管理委員會（101年7月1日更名為「金融監督管理委員會」），分別為 金融監督管理委員會保險局、金融監督管理委員會銀行局、金融監督管理委員會證券期貨局；另中央存款保險公司配合股權移轉，自100年1月1日起改隸金融監督管理委員會。
本部依組織法規定，掌理事項如下：
- 國庫及支付業務。
- 賦稅。
- 關務。
- 國有財產。
- 財政資訊。
- 政府採購（現階段政府採購業務仍由行政院公共工程委員會辦理，有關本部及所屬財政資訊中心組織法之政府採購相關職掌事項，經行政院101年12月18日院授研綜字第1012261456號令核定暫緩施行）。
- 促進民間參與公共建設。
- 所屬財政人員訓練機構之督導。
- 其他有關財政事項。
本部所屬機關（構）執掌事項說明如下：
一、國庫署
- 國庫制度之規劃與管理、中央政府歲入預算籌編及國庫財務調度。
- 國庫集中支付業務之管制及庫款撥付作業。
- 公共債務制度之規劃與管理、中央債務舉借及還本付息。
- 政府重大經建、社會福利等財務規劃之核議與公益彩券發行、運用之管理及監督。
- 公股股權及非稅課收入之管理。
- 地方財政之輔導及監督。
- 菸酒管理制度之規劃、管理及查緝。
- 國庫資訊業務規劃、設計、分析、維護與電腦設備安全防護、管制及維修管理。
- 其他有關國庫與支付業務之規劃及管理事項。
二、賦稅署
- 所得稅法規之訂定、修正、解釋之研議及稽徵業務之規劃、解答。
- 營業稅、證券交易稅、期貨交易稅、印花稅、貨物稅、菸酒稅各稅法規之訂定、修正、解釋之研議及稽徵業務之規劃、解答。
- 遺產及贈與稅、土地稅、房屋稅、使用牌照稅、契稅、娛樂稅各稅法規之訂定、修正、解釋之研議及稽徵業務之規劃、解答。
- 國稅稽徵業務之規劃、指揮、監督、考核、解答及地方稅稽徵業務之規劃、督導、考核、解答。
- 各地區國稅局監察業務之指揮、監督、考核。
- 新增稅目法規之擬訂及稽徵業務之規劃、解答。
- 免稅、減稅、退稅之審核。
- 涉外稅捐。
- 地方稅法通則修正、解釋之研議及地方政府開徵臨時稅、附加稅、特別稅之審議。
- 其他有關賦稅事項。
三、各地區國稅局
- 國稅稽徵業務之研究發展、規劃設計、執行及考核。
- 國稅稅政法令之宣導及納稅服務。
- 國稅之審核。
- 國稅之稽查。
- 國稅之複核。
- 國稅各項課稅資料之調查蒐集、電子作業、資訊處理及運用。
- 國稅之徵收、減免、劃解及退稅。
- 國稅欠稅之清理及債權憑證登記執行。
- 國稅之法制、行政救濟、違章案件及稅務爭議之處理。
- 其他有關國稅稽徵事項。
四、國有財產署
- 國有財產之清查。
- 國有財產之管理。
- 國有財產之處分。
- 國有財產之改良利用。
- 國有財產之資訊業務。
- 國有財產之檢核及統籌調配。
- 國有財產之估價。
- 國有財產法令與法務案件之研議及處理。
- 其他有關國有財產事項。
五、關務署
- 關務政策之規劃、推動、督導及關務法規之擬訂。
- 關稅稅則、稅率政策與制度之規劃及進口稅則分類案件之處理。
- 貨物通關、稅費徵免與代徵、邊境管理之代辦及通關相關業者之管理。
- 查緝走私、邊境管制、情資分析、風險管理、緝毒犬隊建置等查緝業務之規劃、執行及督導。
- 退稅、保稅區、免稅區關務業務政策之規劃、推動及督導。
- 關務資訊業務之規劃、推動、執行及督導。
- 貨物價格調查與事後稽核業務之規劃、執行及督導。
- 關務統計業務之規劃、推動及執行。
- 其他有關關務事項。
六、財政資訊中心
- 財政部資訊體系之整體規劃、協調及研考。
- 財政部與所屬機關（構）資訊作業計畫、設備之審議、作業檢查及績效評核。
- 財政部與所屬機關（構）資訊安全之規劃、宣導及評核。
- 財政資訊作業之整體規劃、系統設計、處理手冊與規範之審訂、訓練及作業之輔導、督導、管制。
- 依稅捐稽徵法與其他相關法律規定執行資料之蒐集、資訊處理及運用。
- 政府採購及民間參與公共建設資訊體系之建立與管理。
- 其他有關財政資訊事項。
七、財政人員訓練所
- 各級政府財政人員訓練之研擬及執行。
- 國稅、地方稅人員訓練之研擬及執行。
- 關務人員訓練之研擬及執行。
- 國有財產管理人員訓練之研擬及執行。
- 與國際財政組織有關訓練之研擬及執行。
- 相關機關指派人員訓練之研擬及執行。
- 其他有關財政人員訓練事項。